Bon, tout d'abord, il n'existe pas à l'heure actuelle de convention entre instn et l'isae. D'après ce que je viens de voir de leur fonctionnement, ils ne proposent une formation que de type 3e année d'école d'ingé pour notre cas.
Il s'agit donc de substitution ou double diplome. Dans les deux cas c'est possible mais va falloir être motivé et négocier un petit peu. De toute façon, la substitution sera plus facile à obtenir que le double diplome. Plus ça va, plus la tendance est à la diversification des domaines des substitutions ou double-diplomes (l'environnement est dorénavant accepté par exemple).
En revanche, rien ne t'empeche d'aller y faire un stage en labo. Tu peux le faire pendant l'année de césure ou ton PFE.
N'hésite pas à reposer des questions si tu en ressens le besoin.